Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRN1Q6UXK5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN1Q6UXK5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN1Q6UXK5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRN1Q6UXK5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN1Q6UXK5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms