Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 594.3 ms