Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Znf280dQ68FE8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Znf280dQ68FE8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Znf280dQ68FE8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Znf280dQ68FE8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Znf280dQ68FE8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Znf280dQ68FE8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Znf280dQ68FE8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Znf280dQ68FE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf280dQ68FE8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf280dQ68FE8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Znf280dQ68FE8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms