Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SVEP1Q4LDE5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SVEP1Q4LDE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SVEP1Q4LDE5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SVEP1Q4LDE5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SVEP1Q4LDE5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms