Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rtl9Q32KG4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtl9Q32KG4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtl9Q32KG4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtl9Q32KG4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl9Q32KG4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl9Q32KG4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtl9Q32KG4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtl9Q32KG4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtl9Q32KG4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtl9Q32KG4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtl9Q32KG4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms