Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNCBQ16143 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNCBQ16143 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNCBQ16143 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNCBQ16143 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNCBQ16143 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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