Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CACNA1EQ15878 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1EQ15878 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1EQ15878 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1EQ15878 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1EQ15878 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1EQ15878 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1EQ15878 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1EQ15878 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1EQ15878 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1EQ15878 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1EQ15878 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA1EQ15878 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1EQ15878 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1EQ15878 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1EQ15878 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1EQ15878 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1EQ15878 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1EQ15878 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1EQ15878 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1EQ15878 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1EQ15878 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA1EQ15878 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1EQ15878 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1EQ15878 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1EQ15878 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms