Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDSNQ15517 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDSNQ15517 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDSNQ15517 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDSNQ15517 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDSNQ15517 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms