Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PSME4Q14997 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSME4Q14997 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PSME4Q14997 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSME4Q14997 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSME4Q14997 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSME4Q14997 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PSME4Q14997 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME4Q14997 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME4Q14997 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME4Q14997 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSME4Q14997 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSME4Q14997 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PSME4Q14997 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PSME4Q14997 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSME4Q14997 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSME4Q14997 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PSME4Q14997 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PSME4Q14997 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PSME4Q14997 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME4Q14997 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME4Q14997 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSME4Q14997 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSME4Q14997 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSME4Q14997 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSME4Q14997 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms