Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CBX2Q14781 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CBX2Q14781 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBX2Q14781 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBX2Q14781 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX2Q14781 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX2Q14781 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBX2Q14781 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBX2Q14781 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CBX2Q14781 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CBX2Q14781 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CBX2Q14781 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CBX2Q14781 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CBX2Q14781 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX2Q14781 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBX2Q14781 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CBX2Q14781 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms