Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGA9Q13797 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA9Q13797 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA9Q13797 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA9Q13797 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGA9Q13797 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA9Q13797 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
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