Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 INH1YDL181W 258 nt8.05□□□□□ -1.12
RTR2Q12378 DLD3YEL071W 1491 nt8.04□□□□□ -1.12
RTR2Q12378 RSC4YKR008W 1878 nt8.03□□□□□ -1.12
RTR2Q12378 DLD2YDL178W 1593 nt8.03□□□□□ -1.12
RTR2Q12378 LSM5YER146W 282 nt8.02□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 FET5YFL041W 1869 nt8.01□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 RAD51YER095W 1203 nt8.01□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 FUN14YAL008W 597 nt8.01□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 STE4YOR212W 1272 nt8.01□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 DUR3YHL016C 2208 nt8.01□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 YLR046CYLR046C 813 nt8□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 YMR103CYMR103C 363 nt8□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 RIM2YBR192W 1134 nt8□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 ALP1YNL270C 1722 nt8□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 YPI1YFR003C 468 nt7.99□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 ADH1YOL086C 1047 nt7.99□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 YJL195CYJL195C 702 nt7.98□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 YLR349WYLR349W 507 nt7.98□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 RPC31YNL151C 756 nt7.98□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 THI6YPL214C 1623 nt7.98□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 GND1YHR183W 1470 nt7.98□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 DUS3YLR401C 2007 nt7.98□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 RTG2YGL252C 1767 nt7.97□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 SEC61YLR378C 1443 nt7.97□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 HEM13YDR044W 987 nt7.97□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 AIM1YAL046C 357 nt7.97□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 AKR2YOR034C 2250 nt7.97□□□□□ -1.13
RTR2Q12378 KRR1YCL059C 951 nt7.95□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 OXA1YER154W 1209 nt7.95□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 LOT5YKL183W 921 nt7.95□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 ORT1YOR130C 879 nt7.95□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 POP2YNR052C 1302 nt7.95□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 LEU4YNL104C 1860 nt7.94□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 ENT4YLL038C 744 nt7.94□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 YNR029CYNR029C 1290 nt7.94□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 DPL1YDR294C 1770 nt7.94□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 YLR173WYLR173W 1827 nt7.94□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 VMA11YPL234C 495 nt7.92□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 MET30YIL046W 1923 nt7.91□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 snR4snR4 186 nt7.91□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 ADE16YLR028C 1776 nt7.91□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 FCY21YER060W 1587 nt7.9□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 NPP2YEL016C 1482 nt7.9□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 TIP1YBR067C 633 nt7.9□□□□□ -1.14
RTR2Q12378 ITR2YOL103W 1830 nt7.89□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 HXT12YIL170W 1374 nt7.88□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 ADH7YCR105W 1086 nt7.88□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 APT2YDR441C 546 nt7.88□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 YEL008WYEL008W 381 nt7.88□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 SMM1YNR015W 1155 nt7.88□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 YNL190WYNL190W 615 nt7.87□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 GCD11YER025W 1584 nt7.86□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 YER188WYER188W 720 nt7.86□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 PAU15YIR041W 375 nt7.86□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 SNX3YOR357C 489 nt7.86□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 TRP2YER090W 1524 nt7.86□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 OSH7YHR001W 1314 nt7.85□□□□□ -1.15
RTR2Q12378 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.84□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 HXT11YOL156W 1704 nt7.83□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 PFS2YNL317W 1398 nt7.83□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 YDR467CYDR467C 327 nt7.82□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.81□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.81□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 CPD1YGR247W 720 nt7.81□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 GPN2YOR262W 1044 nt7.81□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 ECM10YEL030W 1935 nt7.8□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 TAT2YOL020W 1779 nt7.8□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 PRY1YJL079C 900 nt7.8□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 LAS17YOR181W 1902 nt7.8□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 RIB2YOL066C 1776 nt7.79□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.79□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.79□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.79□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 FUB1YCR076C 753 nt7.79□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.79□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.79□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.79□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.79□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 HSV2YGR223C 1347 nt7.78□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 BNI5YNL166C 1347 nt7.78□□□□□ -1.16
RTR2Q12378 SRM1YGL097W 1449 nt7.77□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 EMC3YKL207W 762 nt7.76□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 MSC1YML128C 1542 nt7.76□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.76□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 VRG4YGL225W 1014 nt7.75□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 ESS1YJR017C 513 nt7.75□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 DIA4YHR011W 1341 nt7.74□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 SOL2YCR073W-A 948 nt7.73□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 AIM34YMR003W 597 nt7.73□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 FTH1YBR207W 1398 nt7.72□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 SLM3YDL033C 1254 nt7.72□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.72□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 MDH2YOL126C 1134 nt7.72□□□□□ -1.17
RTR2Q12378 YIL177CYIL177C 5277 nt7.71□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 ADE2YOR128C 1716 nt7.7□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 YMR210WYMR210W 1350 nt7.7□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 FRT1YOR324C 1809 nt7.69□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 CSM1YCR086W 573 nt7.69□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 YJL055WYJL055W 738 nt7.69□□□□□ -1.18
RTR2Q12378 YBL095WYBL095W 813 nt7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms