Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 BSP1YPR171W 1731 nt8.53□□□□□ -1.04
RRP42Q12277 YGL114WYGL114W 2178 nt8.52□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 POT1YIL160C 1254 nt8.5□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 SPS100YHR139C 981 nt8.49□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 YJR114WYJR114W 393 nt8.49□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 HIS2YFR025C 1008 nt8.48□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.48□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 YMR262WYMR262W 942 nt8.48□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 SGA1YIL099W 1650 nt8.48□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.47□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 GID8YMR135C 1368 nt8.47□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 ESBP6YNL125C 2022 nt8.46□□□□□ -1.05
RRP42Q12277 URA8YJR103W 1737 nt8.46□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 ACO2YJL200C 2370 nt8.43□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 SAC7YDR389W 1965 nt8.43□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 TVP23YDR084C 600 nt8.43□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 PAU5YFL020C 369 nt8.43□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 GSF2YML048W 1212 nt8.43□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 YNR064CYNR064C 873 nt8.43□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 DLD3YEL071W 1491 nt8.43□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 ESS1YJR017C 513 nt8.42□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 ABZ2YMR289W 1125 nt8.42□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 YKL133CYKL133C 1392 nt8.42□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 ILV2YMR108W 2064 nt8.42□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 UGP1YKL035W 1500 nt8.41□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 OPI3YJR073C 621 nt8.41□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 GTB1YDR221W 2109 nt8.4□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 TIP1YBR067C 633 nt8.4□□□□□ -1.06
RRP42Q12277 TUB4YLR212C 1422 nt8.39□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 ITR2YOL103W 1830 nt8.39□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 MRS6YOR370C 1812 nt8.39□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 ENO2YHR174W 1314 nt8.38□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 ELO1YJL196C 933 nt8.38□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 STP3YLR375W 1032 nt8.38□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 PGC1YPL206C 966 nt8.38□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 RFC1YOR217W 2586 nt8.37□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 YHR219WYHR219W 1875 nt8.37□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 LSR1LSR1 1175 nt8.37□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 VMA11YPL234C 495 nt8.37□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 APS2YJR058C 444 nt8.36□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 KRE1YNL322C 942 nt8.35□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 RPD3YNL330C 1302 nt8.34□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 KEL3YPL263C 1956 nt8.34□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 NIF3YGL221C 867 nt8.34□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 ZAP1YJL056C 2643 nt8.34□□□□□ -1.07
RRP42Q12277 AMF1YOR378W 1548 nt8.33□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 PAR32YDL173W 888 nt8.32□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 RPN14YGL004C 1254 nt8.31□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 PCP1YGR101W 1041 nt8.31□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 HAP5YOR358W 729 nt8.31□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 YBR232CYBR232C 360 nt8.31□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 YMR265CYMR265C 1386 nt8.31□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 SNX3YOR357C 489 nt8.3□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 TPC1YGR096W 945 nt8.29□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 TIM44YIL022W 1296 nt8.29□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 snR31snR31 225 nt8.29□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 SPE2YOL052C 1191 nt8.28□□□□□ -1.08
RRP42Q12277 DTR1YBR180W 1719 nt8.27□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 CWP2YKL096W-A 279 nt8.27□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 SEN2YLR105C 1134 nt8.27□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 ODC1YPL134C 933 nt8.27□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 SSL2YIL143C 2532 nt8.26□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 SWT21YNL187W 1074 nt8.26□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 LEU2YCL018W 1095 nt8.26□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 SUV3YPL029W 2214 nt8.26□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 YMR209CYMR209C 1374 nt8.24□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 MET1YKR069W 1782 nt8.23□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 SFL1YOR140W 2301 nt8.23□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 THP3YPR045C 1413 nt8.22□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 KRR1YCL059C 951 nt8.22□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 IGD1YFR017C 588 nt8.22□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 NAS2YIL007C 663 nt8.22□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 NAP1YKR048C 1254 nt8.22□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 CRC1YOR100C 984 nt8.22□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 GAL2YLR081W 1725 nt8.21□□□□□ -1.09
RRP42Q12277 RPC31YNL151C 756 nt8.21□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 NAM8YHR086W 1572 nt8.21□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 FSH2YMR222C 672 nt8.2□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 TOK1YJL093C 2076 nt8.19□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 MDM35YKL053C-A 261 nt8.19□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 YKL053WYKL053W 375 nt8.19□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 YJL064WYJL064W 396 nt8.18□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 RIM2YBR192W 1134 nt8.17□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 DMA2YNL116W 1569 nt8.17□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 YKR012CYKR012C 378 nt8.16□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 CDD1YLR245C 429 nt8.16□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 REX2YLR059C 810 nt8.15□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 PAU19YMR325W 375 nt8.15□□□□□ -1.1
RRP42Q12277 YHL008CYHL008C 1884 nt8.15□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 SRP54YPR088C 1626 nt8.14□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 KGD2YDR148C 1392 nt8.13□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 ADH3YMR083W 1128 nt8.13□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.12□□□□□ -1.11
RRP42Q12277 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.12□□□□□ -1.11
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