Protein–RNA interactions for Protein: Q12100

RTK1, Probable serine/threonine-protein kinase RTK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTK1Q12100 FUB1YCR076C 753 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 SHY1YGR112W 1170 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 YGR139WYGR139W 339 nt8.5□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 YJL067WYJL067W 351 nt8.49□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 URA8YJR103W 1737 nt8.49□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 URA6YKL024C 615 nt8.48□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 YMR007WYMR007W 381 nt8.48□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 TMA23YMR269W 636 nt8.47□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 OYE3YPL171C 1203 nt8.47□□□□□ -1.05
RTK1Q12100 RPL12BYDR418W 498 nt8.46□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 RCR1YBR005W 642 nt8.46□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 SPS100YHR139C 981 nt8.45□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 CDD1YLR245C 429 nt8.45□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 ILV2YMR108W 2064 nt8.44□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 PET8YNL003C 855 nt8.44□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 YOR343CYOR343C 327 nt8.44□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 LYS20YDL182W 1287 nt8.43□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 GTB1YDR221W 2109 nt8.43□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 IMO32YGR031W 1029 nt8.43□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 FLX1YIL134W 936 nt8.43□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 YDR306CYDR306C 1437 nt8.42□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 YGL114WYGL114W 2178 nt8.41□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 PUS7YOR243C 2031 nt8.41□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 NAS2YIL007C 663 nt8.4□□□□□ -1.06
RTK1Q12100 OSH7YHR001W 1314 nt8.39□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 THP3YPR045C 1413 nt8.38□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 DTR1YBR180W 1719 nt8.38□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.38□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 PAU21YOR394W 495 nt8.38□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 PAU22YPL282C 495 nt8.38□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 DLD2YDL178W 1593 nt8.38□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 RFC1YOR217W 2586 nt8.37□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 DDI1YER143W 1287 nt8.37□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 FSH2YMR222C 672 nt8.37□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 SER2YGR208W 930 nt8.35□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 RRT8YOL048C 1029 nt8.35□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 YOR268CYOR268C 399 nt8.35□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 HOL1YNR055C 1761 nt8.35□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 HRA1HRA1 564 nt8.34□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 MUP1YGR055W 1725 nt8.34□□□□□ -1.07
RTK1Q12100 ILV3YJR016C 1758 nt8.33□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 LSM5YER146W 282 nt8.33□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 CYC3YAL039C 810 nt8.33□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 ABZ2YMR289W 1125 nt8.33□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 FLR1YBR008C 1647 nt8.32□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 HTS1YPR033C 1641 nt8.32□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 SOL2YCR073W-A 948 nt8.32□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.32□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 CSM2YIL132C 642 nt8.32□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 RSC8YFR037C 1674 nt8.32□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 MFG1YDL233W 1377 nt8.31□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 YPS3YLR121C 1527 nt8.3□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 TVP23YDR084C 600 nt8.3□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 YOR325WYOR325W 474 nt8.3□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 ADE8YDR408C 645 nt8.29□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 PHB2YGR231C 933 nt8.29□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 NAS6YGR232W 687 nt8.29□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 BET2YPR176C 978 nt8.29□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 GAL2YLR081W 1725 nt8.29□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 ADH3YMR083W 1128 nt8.28□□□□□ -1.08
RTK1Q12100 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.27□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 SPE2YOL052C 1191 nt8.27□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 TOS1YBR162C 1368 nt8.26□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 GRH1YDR517W 1119 nt8.26□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 FMS1YMR020W 1527 nt8.25□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 HEM13YDR044W 987 nt8.25□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 MOB1YIL106W 945 nt8.25□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 CWC15YDR163W 528 nt8.24□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 PCP1YGR101W 1041 nt8.24□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 TOK1YJL093C 2076 nt8.23□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 EDC2YER035W 438 nt8.23□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 SRP102YKL154W 735 nt8.22□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 OPI10YOL032W 741 nt8.22□□□□□ -1.09
RTK1Q12100 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.21□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.21□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.21□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.21□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 YDR455CYDR455C 309 nt8.2□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 SPP2YOR148C 558 nt8.2□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 YPL041CYPL041C 624 nt8.2□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 DIG1YPL049C 1359 nt8.2□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 CCT2YIL142W 1584 nt8.19□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 HOG1YLR113W 1308 nt8.19□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 TAT2YOL020W 1779 nt8.19□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 ERG13YML126C 1476 nt8.19□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 COQ8YGL119W 1506 nt8.18□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 MRP1YDR347W 966 nt8.17□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 YGR210CYGR210C 1236 nt8.17□□□□□ -1.1
RTK1Q12100 ARO8YGL202W 1503 nt8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.7 ms