Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
F13bQ07968 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
F13bQ07968 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
F13bQ07968 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
F13bQ07968 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
F13bQ07968 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13bQ07968 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F13bQ07968 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13bQ07968 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F13bQ07968 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13bQ07968 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13bQ07968 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13bQ07968 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
F13bQ07968 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F13bQ07968 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms