Protein–RNA interactions for Protein: Q06628

ATG13, Autophagy-related protein 13, yeastyeast

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG13Q06628 YMR007WYMR007W 381 nt11.01□□□□□ -0.65
ATG13Q06628 RRT8YOL048C 1029 nt11.01□□□□□ -0.65
ATG13Q06628 THP3YPR045C 1413 nt11.01□□□□□ -0.65
ATG13Q06628 ABZ2YMR289W 1125 nt10.99□□□□□ -0.65
ATG13Q06628 BIO5YNR056C 1686 nt10.98□□□□□ -0.65
ATG13Q06628 ADE8YDR408C 645 nt10.97□□□□□ -0.65
ATG13Q06628 RCR1YBR005W 642 nt10.97□□□□□ -0.65
ATG13Q06628 TVP23YDR084C 600 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG13Q06628 YDR455CYDR455C 309 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG13Q06628 SPP2YOR148C 558 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG13Q06628 TAT2YOL020W 1779 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 SPE2YOL052C 1191 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 YJL067WYJL067W 351 nt10.94□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 SER2YGR208W 930 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 FSH2YMR222C 672 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 PHB2YGR231C 933 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 ADH3YMR083W 1128 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 YOR343CYOR343C 327 nt10.91□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 NME1NME1 340 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG13Q06628 CYC3YAL039C 810 nt10.89□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 ERG13YML126C 1476 nt10.88□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 RPL12BYDR418W 498 nt10.88□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 PAU21YOR394W 495 nt10.88□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 PAU22YPL282C 495 nt10.88□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 CWC15YDR163W 528 nt10.87□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 MOB1YIL106W 945 nt10.87□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 HTS1YPR033C 1641 nt10.87□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 BET2YPR176C 978 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 ACH1YBL015W 1581 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 FRE6YLL051C 2139 nt10.84□□□□□ -0.67
ATG13Q06628 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt10.83□□□□□ -0.68
ATG13Q06628 OPI3YJR073C 621 nt10.83□□□□□ -0.68
ATG13Q06628 VPS62YGR141W 1404 nt10.83□□□□□ -0.68
ATG13Q06628 ENO2YHR174W 1314 nt10.82□□□□□ -0.68
ATG13Q06628 HRA1HRA1 564 nt10.81□□□□□ -0.68
ATG13Q06628 TPC1YGR096W 945 nt10.79□□□□□ -0.68
ATG13Q06628 ALG12YNR030W 1656 nt10.79□□□□□ -0.68
ATG13Q06628 PCP1YGR101W 1041 nt10.78□□□□□ -0.68
ATG13Q06628 AMF1YOR378W 1548 nt10.78□□□□□ -0.68
ATG13Q06628 DIG1YPL049C 1359 nt10.77□□□□□ -0.68
ATG13Q06628 GRH1YDR517W 1119 nt10.76□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 YKR012CYKR012C 378 nt10.76□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 YOR268CYOR268C 399 nt10.76□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 YDL086WYDL086W 822 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 SRP102YKL154W 735 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 YGR210CYGR210C 1236 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 LEU2YCL018W 1095 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 LSB6YJL100W 1824 nt10.72□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 YGR139WYGR139W 339 nt10.72□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 FCY1YPR062W 477 nt10.71□□□□□ -0.69
ATG13Q06628 SAC7YDR389W 1965 nt10.7□□□□□ -0.7
ATG13Q06628 ERO1YML130C 1692 nt10.69□□□□□ -0.7
ATG13Q06628 SDS24YBR214W 1584 nt10.69□□□□□ -0.7
ATG13Q06628 ENO1YGR254W 1314 nt10.69□□□□□ -0.7
ATG13Q06628 MFG1YDL233W 1377 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG13Q06628 AIM1YAL046C 357 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG13Q06628 YLR280CYLR280C 351 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG13Q06628 NAM8YHR086W 1572 nt10.65□□□□□ -0.7
ATG13Q06628 PBP1YGR178C 2169 nt10.65□□□□□ -0.7
ATG13Q06628 YNR064CYNR064C 873 nt10.65□□□□□ -0.7
ATG13Q06628 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.64□□□□□ -0.71
ATG13Q06628 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.64□□□□□ -0.71
ATG13Q06628 EMC3YKL207W 762 nt10.64□□□□□ -0.71
ATG13Q06628 ENT4YLL038C 744 nt10.63□□□□□ -0.71
ATG13Q06628 MRP1YDR347W 966 nt10.62□□□□□ -0.71
ATG13Q06628 YPL108WYPL108W 507 nt10.62□□□□□ -0.71
ATG13Q06628 VBA3YCL069W 1377 nt10.62□□□□□ -0.71
ATG13Q06628 EDC2YER035W 438 nt10.6□□□□□ -0.71
ATG13Q06628 YJL160CYJL160C 864 nt10.6□□□□□ -0.71
ATG13Q06628 RIM2YBR192W 1134 nt10.57□□□□□ -0.72
ATG13Q06628 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG13Q06628 CYT2YKL087C 675 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG13Q06628 YMR210WYMR210W 1350 nt10.55□□□□□ -0.72
ATG13Q06628 REX2YLR059C 810 nt10.55□□□□□ -0.72
ATG13Q06628 SWT21YNL187W 1074 nt10.54□□□□□ -0.72
ATG13Q06628 KEL3YPL263C 1956 nt10.54□□□□□ -0.72
ATG13Q06628 TOS1YBR162C 1368 nt10.53□□□□□ -0.72
ATG13Q06628 HOG1YLR113W 1308 nt10.53□□□□□ -0.72
ATG13Q06628 YLR046CYLR046C 813 nt10.51□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 ELO1YJL196C 933 nt10.5□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 YMR206WYMR206W 942 nt10.5□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 GDH1YOR375C 1365 nt10.49□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 SFL1YOR140W 2301 nt10.49□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 CCT2YIL142W 1584 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG13Q06628 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms