Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNX1T1Q06455 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNX1T1Q06455 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX1T1Q06455 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUNX1T1Q06455 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms