Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 LSM5YER146W 282 nt7.14□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 YHL008CYHL008C 1884 nt7.14□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 MET2YNL277W 1461 nt7.14□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 RRT8YOL048C 1029 nt7.14□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 CYT1YOR065W 930 nt7.14□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 YLR349WYLR349W 507 nt7.13□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 YMR262WYMR262W 942 nt7.13□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 RIB7YBR153W 735 nt7.13□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 HXT10YFL011W 1641 nt7.12□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 GID7YCL039W 2238 nt7.12□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 RAD51YER095W 1203 nt7.11□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 IMO32YGR031W 1029 nt7.11□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 ADH7YCR105W 1086 nt7.1□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 TIM44YIL022W 1296 nt7.1□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 RPC31YNL151C 756 nt7.1□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 RIM2YBR192W 1134 nt7.1□□□□□ -1.27
YHP1Q04116 DPL1YDR294C 1770 nt7.08□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 AGP3YFL055W 1677 nt7.07□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 PAU15YIR041W 375 nt7.07□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 SNX3YOR357C 489 nt7.07□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 TIP1YBR067C 633 nt7.07□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 DAK2YFL053W 1776 nt7.06□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 KRR1YCL059C 951 nt7.06□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 CPD1YGR247W 720 nt7.06□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 YNR064CYNR064C 873 nt7.05□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 YMR265CYMR265C 1386 nt7.05□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 ADE8YDR408C 645 nt7.04□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 ELO1YJL196C 933 nt7.04□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 OPI3YJR073C 621 nt7.04□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 SNZ1YMR096W 894 nt7.04□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 CCT5YJR064W 1689 nt7.03□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 SUV3YPL029W 2214 nt7.03□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 YJR114WYJR114W 393 nt7.03□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 YPR126CYPR126C 309 nt7.03□□□□□ -1.28
YHP1Q04116 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.02□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 HAP5YOR358W 729 nt7.02□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 SFP1YLR403W 2052 nt7□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 SFL1YOR140W 2301 nt7□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 LEU4YNL104C 1860 nt7□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 HMG2YLR450W 3138 nt6.98□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 NBA1YOL070C 1506 nt6.98□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 KEL3YPL263C 1956 nt6.98□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 THI72YOR192C 1800 nt6.97□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 TVP23YDR084C 600 nt6.97□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt6.97□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt6.97□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 TAF13YML098W 504 nt6.97□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 SWT21YNL187W 1074 nt6.97□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 TPO4YOR273C 1980 nt6.97□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 NPP1YCR026C 2229 nt6.96□□□□□ -1.29
YHP1Q04116 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt6.96□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 INH1YDL181W 258 nt6.95□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 RPN14YGL004C 1254 nt6.95□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 CRC1YOR100C 984 nt6.95□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 FET5YFL041W 1869 nt6.94□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 BSP1YPR171W 1731 nt6.93□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 SPS100YHR139C 981 nt6.93□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 ESS1YJR017C 513 nt6.93□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 NPP2YEL016C 1482 nt6.92□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 PCP1YGR101W 1041 nt6.92□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 MET1YKR069W 1782 nt6.92□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 YDR467CYDR467C 327 nt6.91□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 CTI6YPL181W 1521 nt6.91□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 MHF1YOL086W-A 273 nt6.9□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 IML3YBR107C 738 nt6.9□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 snR31snR31 225 nt6.9□□□□□ -1.3
YHP1Q04116 PAU5YFL020C 369 nt6.89□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 ALD5YER073W 1563 nt6.89□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 HXK1YFR053C 1458 nt6.88□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 ABZ2YMR289W 1125 nt6.88□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 KGD2YDR148C 1392 nt6.87□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 POT1YIL160C 1254 nt6.87□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 ESBP6YNL125C 2022 nt6.86□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 GPM1YKL152C 744 nt6.86□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 STP3YLR375W 1032 nt6.86□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 AMF1YOR378W 1548 nt6.86□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 YKL053WYKL053W 375 nt6.85□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 PGC1YPL206C 966 nt6.85□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 THI3YDL080C 1830 nt6.85□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 SAN1YDR143C 1833 nt6.85□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 GSF2YML048W 1212 nt6.84□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt6.84□□□□□ -1.31
YHP1Q04116 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 YBL095WYBL095W 813 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 HXT11YOL156W 1704 nt6.83□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 ILV2YMR108W 2064 nt6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms