Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Ank1Q02357 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Ank1Q02357 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ank1Q02357 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ank1Q02357 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Ank1Q02357 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Ank1Q02357 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Ank1Q02357 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Ank1Q02357 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Ank1Q02357 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Ank1Q02357 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Ank1Q02357 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Ank1Q02357 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Ank1Q02357 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Ank1Q02357 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Ank1Q02357 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Ank1Q02357 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Ank1Q02357 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Ank1Q02357 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30,45■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Ank1Q02357 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ank1Q02357 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ank1Q02357 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ank1Q02357 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Ank1Q02357 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Ank1Q02357 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Ank1Q02357 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Ank1Q02357 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Ank1Q02357 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Ank1Q02357 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Ank1Q02357 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Ank1Q02357 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ank1Q02357 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ank1Q02357 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ank1Q02357 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Ank1Q02357 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ank1Q02357 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,9 ms