Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCN7AQ01118 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN7AQ01118 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCN7AQ01118 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCN7AQ01118 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCN7AQ01118 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCN7AQ01118 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCN7AQ01118 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCN7AQ01118 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCN7AQ01118 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCN7AQ01118 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCN7AQ01118 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCN7AQ01118 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCN7AQ01118 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SCN7AQ01118 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms