Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Irf5P56477 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Irf5P56477 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Irf5P56477 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Irf5P56477 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irf5P56477 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irf5P56477 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Irf5P56477 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Irf5P56477 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Irf5P56477 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Irf5P56477 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Irf5P56477 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Irf5P56477 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Irf5P56477 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Irf5P56477 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irf5P56477 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irf5P56477 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Irf5P56477 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irf5P56477 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irf5P56477 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irf5P56477 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Irf5P56477 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irf5P56477 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irf5P56477 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irf5P56477 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irf5P56477 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irf5P56477 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irf5P56477 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms