Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
OXCT1P55809 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OXCT1P55809 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OXCT1P55809 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OXCT1P55809 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OXCT1P55809 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms