Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HK3P52790 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HK3P52790 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HK3P52790 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HK3P52790 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HK3P52790 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HK3P52790 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HK3P52790 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HK3P52790 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HK3P52790 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HK3P52790 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HK3P52790 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HK3P52790 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HK3P52790 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HK3P52790 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HK3P52790 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HK3P52790 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HK3P52790 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HK3P52790 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HK3P52790 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HK3P52790 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HK3P52790 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HK3P52790 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HK3P52790 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HK3P52790 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HK3P52790 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HK3P52790 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HK3P52790 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HK3P52790 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HK3P52790 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HK3P52790 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HK3P52790 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HK3P52790 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HK3P52790 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HK3P52790 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HK3P52790 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HK3P52790 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HK3P52790 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HK3P52790 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HK3P52790 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HK3P52790 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HK3P52790 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HK3P52790 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HK3P52790 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HK3P52790 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HK3P52790 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HK3P52790 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HK3P52790 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HK3P52790 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HK3P52790 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HK3P52790 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HK3P52790 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HK3P52790 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HK3P52790 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HK3P52790 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HK3P52790 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HK3P52790 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HK3P52790 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HK3P52790 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HK3P52790 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HK3P52790 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HK3P52790 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HK3P52790 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HK3P52790 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HK3P52790 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HK3P52790 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HK3P52790 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HK3P52790 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HK3P52790 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HK3P52790 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HK3P52790 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HK3P52790 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HK3P52790 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HK3P52790 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HK3P52790 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HK3P52790 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HK3P52790 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HK3P52790 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HK3P52790 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HK3P52790 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HK3P52790 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HK3P52790 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HK3P52790 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HK3P52790 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HK3P52790 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HK3P52790 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HK3P52790 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HK3P52790 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HK3P52790 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
HK3P52790 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HK3P52790 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HK3P52790 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HK3P52790 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HK3P52790 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HK3P52790 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HK3P52790 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HK3P52790 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HK3P52790 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HK3P52790 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HK3P52790 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms