Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN5P51795 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN5P51795 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN5P51795 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN5P51795 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN5P51795 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN5P51795 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN5P51795 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN5P51795 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN5P51795 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN5P51795 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLCN5P51795 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN5P51795 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN5P51795 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLCN5P51795 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLCN5P51795 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLCN5P51795 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLCN5P51795 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CLCN5P51795 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLCN5P51795 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCN5P51795 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCN5P51795 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCN5P51795 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCN5P51795 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms