Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXA10P31260 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXA10P31260 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXA10P31260 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXA10P31260 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HOXA10P31260 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HOXA10P31260 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HOXA10P31260 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HOXA10P31260 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HOXA10P31260 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HOXA10P31260 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HOXA10P31260 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXA10P31260 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXA10P31260 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
HOXA10P31260 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HOXA10P31260 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXA10P31260 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXA10P31260 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HOXA10P31260 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HOXA10P31260 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HOXA10P31260 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HOXA10P31260 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
HOXA10P31260 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HOXA10P31260 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HOXA10P31260 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HOXA10P31260 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HOXA10P31260 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
HOXA10P31260 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HOXA10P31260 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HOXA10P31260 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXA10P31260 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXA10P31260 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HOXA10P31260 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms