Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA1P25391 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA1P25391 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA1P25391 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA1P25391 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMA1P25391 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMA1P25391 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms