Protein–RNA interactions for Protein: P0CX85

RPL35B, 60S ribosomal protein L35-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL35BP0CX85 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.67□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 NAP1YKR048C 1254 nt7.67□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 SNZ1YMR096W 894 nt7.67□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 RRT8YOL048C 1029 nt7.67□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 ALR1YOL130W 2580 nt7.66□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 DUR3YHL016C 2208 nt7.66□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 IMO32YGR031W 1029 nt7.66□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 YBR232CYBR232C 360 nt7.66□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 SNU66YOR308C 1764 nt7.66□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.66□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.66□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.66□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 MTO1YGL236C 2010 nt7.66□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 CTI6YPL181W 1521 nt7.65□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 PGC1YPL206C 966 nt7.65□□□□□ -1.18
RPL35BP0CX85 PAR32YDL173W 888 nt7.64□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 PAU5YFL020C 369 nt7.64□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.64□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.64□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.64□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.64□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 RPC82YPR190C 1965 nt7.63□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 YMR262WYMR262W 942 nt7.62□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 OPI10YOL032W 741 nt7.62□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 THI6YPL214C 1623 nt7.62□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 TUB4YLR212C 1422 nt7.61□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 ENT4YLL038C 744 nt7.61□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 SEN2YLR105C 1134 nt7.61□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 LSM5YER146W 282 nt7.6□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 ADE2YOR128C 1716 nt7.6□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 GCD11YER025W 1584 nt7.59□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 DDI1YER143W 1287 nt7.59□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 SPS100YHR139C 981 nt7.59□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 PUS7YOR243C 2031 nt7.59□□□□□ -1.19
RPL35BP0CX85 HXK1YFR053C 1458 nt7.58□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 CCT2YIL142W 1584 nt7.58□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 TAT2YOL020W 1779 nt7.56□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 TVP23YDR084C 600 nt7.55□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 YHL008CYHL008C 1884 nt7.54□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 ERG13YML126C 1476 nt7.54□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 ADE8YDR408C 645 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 YDR455CYDR455C 309 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 YJR114WYJR114W 393 nt7.53□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 MUP1YGR055W 1725 nt7.52□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 YIL177CYIL177C 5277 nt7.52□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 MDL2YPL270W 2322 nt7.52□□□□□ -1.2
RPL35BP0CX85 DIG1YPL049C 1359 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 NIF3YGL221C 867 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 SSL2YIL143C 2532 nt7.52□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 MAM3YOL060C 2121 nt7.51□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 AIM1YAL046C 357 nt7.51□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 YJL064WYJL064W 396 nt7.5□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 PAU19YMR325W 375 nt7.5□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 PUP1YOR157C 786 nt7.5□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 YOR325WYOR325W 474 nt7.5□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 ALD5YER073W 1563 nt7.5□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.49□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 ABZ2YMR289W 1125 nt7.49□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 APS2YJR058C 444 nt7.48□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 YLR046CYLR046C 813 nt7.47□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.47□□□□□ -1.21
RPL35BP0CX85 FSH2YMR222C 672 nt7.46□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 BET2YPR176C 978 nt7.46□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 LSB6YJL100W 1824 nt7.45□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 IGD1YFR017C 588 nt7.44□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 TIM44YIL022W 1296 nt7.44□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 OPI3YJR073C 621 nt7.44□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 SAC7YDR389W 1965 nt7.44□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 ECM10YEL030W 1935 nt7.43□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 QDR2YIL121W 1629 nt7.43□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 YNR064CYNR064C 873 nt7.43□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 THP3YPR045C 1413 nt7.42□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 AMF1YOR378W 1548 nt7.42□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 KRE1YNL322C 942 nt7.41□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 ARO8YGL202W 1503 nt7.41□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 YEL023CYEL023C 2049 nt7.4□□□□□ -1.22
RPL35BP0CX85 KEL3YPL263C 1956 nt7.4□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 HOL1YNR055C 1761 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 COQ8YGL119W 1506 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 ENO2YHR174W 1314 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 PCP1YGR101W 1041 nt7.39□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 DLD3YEL071W 1491 nt7.38□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 KES1YPL145C 1305 nt7.38□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 snR31snR31 225 nt7.38□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 LEU2YCL018W 1095 nt7.38□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 KRR1YCL059C 951 nt7.37□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 RPN14YGL004C 1254 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 IPL1YPL209C 1104 nt7.36□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 VMA11YPL234C 495 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 SGA1YIL099W 1650 nt7.35□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 YCP4YCR004C 744 nt7.34□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 NAS2YIL007C 663 nt7.34□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 CDD1YLR245C 429 nt7.34□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 TIP1YBR067C 633 nt7.34□□□□□ -1.23
RPL35BP0CX85 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.33□□□□□ -1.24
RPL35BP0CX85 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms