Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNK3O14649 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNK3O14649 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNK3O14649 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNK3O14649 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNK3O14649 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KCNK3O14649 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNK3O14649 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNK3O14649 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNK3O14649 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNK3O14649 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNK3O14649 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNK3O14649 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNK3O14649 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNK3O14649 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNK3O14649 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNK3O14649 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms