Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms