Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sbf2E9PXF8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sbf2E9PXF8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sbf2E9PXF8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sbf2E9PXF8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sbf2E9PXF8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbf2E9PXF8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbf2E9PXF8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sbf2E9PXF8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sbf2E9PXF8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbf2E9PXF8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbf2E9PXF8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sbf2E9PXF8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sbf2E9PXF8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbf2E9PXF8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sbf2E9PXF8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Sbf2E9PXF8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sbf2E9PXF8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sbf2E9PXF8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms