Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP29-1A8MX34 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP29-1A8MX34 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP29-1A8MX34 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP29-1A8MX34 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP29-1A8MX34 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP29-1A8MX34 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP29-1A8MX34 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP29-1A8MX34 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP29-1A8MX34 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KRTAP29-1A8MX34 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP29-1A8MX34 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms