Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms