Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
V9GYQ6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
V9GYQ6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
V9GYQ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
V9GYQ6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
V9GYQ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
V9GYQ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms