Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA3Q9Y6H8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA3Q9Y6H8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms