Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAXBP1Q9Y5B6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms