Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms