Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHDC2Q9Y2U9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHDC2Q9Y2U9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms