Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LEMD3Q9Y2U8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LEMD3Q9Y2U8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms