Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBNO2Q9Y2G9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms