Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms