Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC12A4Q9UP95 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC12A4Q9UP95 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms