Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALKQ9UM73 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms