Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VANGL2Q9ULK5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VANGL2Q9ULK5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms