Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ITGA11Q9UKX5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms