Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms