Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP4Q9UKK3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PARP4Q9UKK3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms