Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSKSQ9UJT2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms