Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATPIF1Q9UII2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms