Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNA3Q9UI47 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms