Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms